282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2021 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 334 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  92.81 
 
 		 336 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  86.82 
 
 		 339 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  57.01 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  60.54 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  54.97 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  50.16 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  51.72 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  47.52 
 
 		 326 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  47.65 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  45.29 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  47.14 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  45.48 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  44.24 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  44.34 
 
 		 314 aa  262  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  45.89 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  38.91 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  40.8 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  44.21 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  42.96 
 
 		 322 aa  243  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  41.58 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  45.8 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  42.62 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  45.45 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  42.37 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  41.61 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  44.08 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  44.08 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  44.76 
 
 		 344 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  39.5 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  42.4 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  42.25 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  42.25 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  38.81 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  35.62 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  39.31 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 		 315 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  38.63 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 329 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  36.46 
 
 		 277 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  37.01 
 
 		 277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 		 291 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  33.22 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  36.56 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 279 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  34 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.6 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  39.56 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.55 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  38.57 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  30.67 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  32.97 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  32.85 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  38.12 
 
 		 279 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.05 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  34.05 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  31.82 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  34.81 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  32.51 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>