More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3769 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 326 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  33.56 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  31.38 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  33.43 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 		 291 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  30.38 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  32.09 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.36 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  34.67 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  32.85 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  32.62 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.16 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  31.37 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.52 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 279 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  30.18 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  35.12 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  29.47 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  31.97 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  32.72 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  33.62 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30.74 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  30.22 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  28.52 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 287 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  32.26 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.39 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  26.33 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  31.64 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.93 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>