278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2457 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  98.37 
 
 
309 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  88.27 
 
 
306 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  66.91 
 
 
305 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  51.86 
 
 
326 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  47.52 
 
 
330 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  48.69 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.52 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  53.7 
 
 
312 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  47.83 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  48.53 
 
 
311 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  44.79 
 
 
333 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
331 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 
304 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  35.14 
 
 
330 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  40.14 
 
 
320 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  35.37 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  33.99 
 
 
327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  35.35 
 
 
329 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  34.71 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  32.52 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
326 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  36.56 
 
 
322 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
324 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 
327 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 
329 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 
336 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
324 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  32.32 
 
 
327 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  33.23 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
332 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  32.64 
 
 
329 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 
303 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  33.11 
 
 
330 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
311 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  33.57 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 
326 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 
327 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  32.21 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  29.84 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  31.94 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  32.33 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  32.09 
 
 
339 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.83 
 
 
321 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
329 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  30.9 
 
 
339 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
320 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 
316 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  29.31 
 
 
327 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
321 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 
324 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  29.81 
 
 
332 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 
285 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 
293 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
293 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  33.94 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  32.53 
 
 
326 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  35.08 
 
 
282 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.85 
 
 
287 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  30.03 
 
 
348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 
348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.36 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
279 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
291 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
324 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 
317 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 
318 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 
306 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
293 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
322 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 
310 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
311 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
302 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
310 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  33.92 
 
 
277 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  30.45 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
282 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  33.51 
 
 
282 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 
305 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
305 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.41 
 
 
277 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 
266 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  34.21 
 
 
283 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
310 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>