258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0380 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  620  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  87.99 
 
 		 309 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  88.31 
 
 		 307 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  63.97 
 
 		 305 aa  351  8.999999999999999e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  53.21 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  51.31 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  49.65 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  52.96 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  45.9 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.48 
 
 		 293 aa  271  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  43.87 
 
 		 333 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 		 320 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  39.65 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  35.15 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  33.22 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  33.12 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  35.25 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  34.13 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  35.45 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 329 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  32.57 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.1 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  33.67 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 327 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  31.21 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  31.25 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  30.75 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  36.55 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  30.1 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  31.6 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  31.21 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  28.7 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  31.65 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  30.98 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  30.41 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.46 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 282 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  31.83 
 
 		 326 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.63 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  29.51 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  27.67 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  32.01 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.56 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.86 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  28.77 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>