264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2909 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  45.96 
 
 		 324 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 		 327 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  36.24 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  36.24 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  37.06 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  37.32 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  33.9 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  32.65 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  34.17 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  31.31 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  29.94 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  35.53 
 
 		 277 aa  149  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  30.48 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  34.29 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  35.5 
 
 		 238 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  34.58 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.25 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  29.93 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  33.1 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  29.39 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 278 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.57 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.91 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.18 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.23 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  29.79 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  29.5 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.63 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  28.01 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  29.97 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.31 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  26.13 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>