262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5354 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  80.62 
 
 		 320 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  50.45 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  45.49 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  44.67 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  43.75 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  43.99 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  43.49 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  37.59 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  37.76 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  33.85 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  34.03 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  32.04 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  36.73 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 331 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.07 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  34.28 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  34.88 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  33.53 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.76 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  34.8 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  33.43 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  31.46 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  37.76 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  36.53 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  38.77 
 
 		 238 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  37.05 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.37 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.8 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  32.93 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  36.64 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.89 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  33.82 
 
 		 287 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  32.86 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  32.23 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  28.22 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  33.89 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  34.06 
 
 		 287 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  36.01 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  31.94 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  33.22 
 
 		 339 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  30.69 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  32.34 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  28.83 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>