257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4159 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  62.21 
 
 		 300 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  33.92 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.88 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  33.46 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  34.32 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  33.09 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  32.99 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  31.02 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  31.25 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  35.04 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  33.54 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  32.96 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  33.09 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  31.32 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  32.51 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  38.81 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  36.32 
 
 		 238 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  31.99 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  36.77 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  30.8 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 278 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  34.19 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.43 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  31.64 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  37.9 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  31.43 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  30.11 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32.1 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  30.85 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  28.88 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  28.1 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  31.88 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.52 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  30.55 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>