295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3845 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  63.87 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  61.87 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  53.55 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  51.02 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  49.19 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  47.04 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  47.65 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 		 329 aa  297  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  48.49 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  46.34 
 
 		 351 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  43.97 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  47.64 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  49.33 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  44.62 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  46.13 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  44.7 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  45.13 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  46.02 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  48.62 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  41.07 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  44.37 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  43.6 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  44.01 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  44.98 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  44.11 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  44.11 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  43.75 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  39.09 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  37.21 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  37.16 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  38.77 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  36.69 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  37.41 
 
 		 293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  32.99 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.07 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  35.18 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.89 
 
 		 321 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  36.58 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 		 293 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  32.77 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.72 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  32.31 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  35.87 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  33.09 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  32.53 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  32.3 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  31.23 
 
 		 272 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  32.55 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  28.67 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  30.8 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>