259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3467 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  100 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  34.47 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  35.42 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  35.42 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 		 279 aa  141  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  35.78 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  32.35 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  31.23 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  32.34 
 
 		 328 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  33.82 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  32.58 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  34.46 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  31.09 
 
 		 339 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  30.34 
 
 		 339 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  29.82 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  32.48 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  36.89 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 341 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  29.48 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  31.37 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 		 344 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 329 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  31.87 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 327 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  28.83 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.22 
 
 		 321 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  29.08 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.76 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  27.27 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  29.78 
 
 		 327 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 329 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  27.55 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 324 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 		 310 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  29.01 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  28.21 
 
 		 329 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 326 aa  92  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  31.82 
 
 		 300 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 		 330 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  28.16 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  27.1 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>