290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1641 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  677    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  55.78 
 
 
329 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  54.42 
 
 
329 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  55.1 
 
 
330 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  55.29 
 
 
329 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  50.17 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  52.69 
 
 
322 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  51.43 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  43.71 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 
293 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  36.03 
 
 
293 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  34.28 
 
 
324 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  33.43 
 
 
322 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  34.19 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  33.55 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
334 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 
329 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  33.83 
 
 
332 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  34.83 
 
 
339 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 
290 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 
336 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  34.97 
 
 
329 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  34.23 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  35.31 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
313 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
324 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
333 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  34.75 
 
 
330 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  35.61 
 
 
281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 
327 aa  165  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  35.02 
 
 
279 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
281 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 
279 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  33.33 
 
 
339 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  32.52 
 
 
315 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  32.34 
 
 
283 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 
287 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 
326 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  31.36 
 
 
321 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 
327 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
311 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 
316 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
332 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
315 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 
324 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
287 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
279 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
330 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  34.09 
 
 
238 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 
301 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 
322 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
330 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
279 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
314 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
321 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.3 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  32.71 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 
279 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.16 
 
 
312 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 
320 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
301 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.51 
 
 
293 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 
315 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  32.67 
 
 
342 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 
304 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 
341 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 
306 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  30.97 
 
 
351 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
278 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
311 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  30.31 
 
 
327 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 
291 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 
312 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 
314 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  32.79 
 
 
319 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 
291 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  32.18 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.88 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  31.83 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  27.71 
 
 
327 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
310 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
310 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>