More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5667 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 321 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  52.08 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  49.31 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  47.77 
 
 		 320 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  46.86 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  45.31 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  46.73 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  45.58 
 
 		 314 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  44.91 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  44.38 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  44.76 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  43.69 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  44.14 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  41.03 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  43.51 
 
 		 342 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  42.72 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  44.21 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  44.37 
 
 		 339 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  41.55 
 
 		 351 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  43.51 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  42.46 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  39.94 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  39.94 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  41.81 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  41.28 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  41.28 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  40.78 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  43.46 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 		 341 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  36.73 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  35.43 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  35.82 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  34.14 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  34.56 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.77 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 326 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.68 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.07 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  33.11 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  35.82 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  34.47 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.48 
 
 		 283 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  32.71 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  29.72 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.11 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  36.49 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  29.39 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 329 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  29.43 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  31.85 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  31.16 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>