238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2486 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 330 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  87.88 
 
 		 329 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  77.27 
 
 		 329 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  72.12 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  56.51 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  53.85 
 
 		 336 aa  345  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  47.3 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  45.45 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  45.1 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  37.01 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  35.76 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  36.09 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  34.18 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  33.23 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  36 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.79 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  33.22 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  33.74 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  34.71 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  31.71 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  32.78 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  33.87 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  33.22 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  36.01 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 		 290 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 287 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  31.17 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  32.49 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  31.9 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  31.04 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  32.2 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  31.56 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  31.29 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  30.54 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30.22 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  28.53 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  30.27 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  32.33 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  31.67 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  29.59 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  29.72 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.27 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  27.3 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>