More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2276 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  56.23 
 
 		 305 aa  308  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  55.05 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  45.23 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  50.96 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  51.54 
 
 		 307 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  50.16 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  43.34 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.21 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  40.89 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  32.54 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  35.13 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.23 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  31.08 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  31.23 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  34.65 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 		 326 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  33.77 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  35.84 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  33.2 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  30.91 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  32.81 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  33.55 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  33.78 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.72 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  36.77 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  31.63 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  31.55 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.19 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.71 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  35.09 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  33.89 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.82 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.51 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  37.43 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  33.48 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  30.61 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  33.62 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  29.45 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  28.86 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  33.62 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  33.62 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>