263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1208 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  71.63 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  71.99 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  66.07 
 
 		 282 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.32 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  40.99 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  37.76 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  42.08 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  41.77 
 
 		 283 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  39.79 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  35.64 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  38.23 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  39.08 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  39.08 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  37.7 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  35.54 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  38.87 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  34.25 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  35.76 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  38.34 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  34.01 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  34.07 
 
 		 312 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.54 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 306 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  34.38 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  29.47 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 334 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 336 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  27.02 
 
 		 327 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  29.22 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  28.81 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  27.38 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 324 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  32.85 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.47 
 
 		 332 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  29.6 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  31.43 
 
 		 348 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 313 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 348 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 		 336 aa  86.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  29.18 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  25.81 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  26.27 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  34.9 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  27.02 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  25.93 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>