More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0301 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
322 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  47.45 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  49.12 
 
 
339 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  48.58 
 
 
326 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  46.29 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  46.03 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  44.41 
 
 
327 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  44.62 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  44.25 
 
 
339 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  43.77 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  42.77 
 
 
324 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  44.29 
 
 
324 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  42.47 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 
334 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 
314 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 
336 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  40 
 
 
351 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 
313 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  40.66 
 
 
330 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  40.5 
 
 
329 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  41.84 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  39.25 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  39.69 
 
 
335 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  42.86 
 
 
327 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  42.12 
 
 
327 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  44.48 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  44.48 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  44.13 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  43.05 
 
 
339 aa  222  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 
324 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  36.73 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  39.3 
 
 
327 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 
341 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  37.96 
 
 
322 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  35.99 
 
 
311 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  36.2 
 
 
277 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 
290 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
293 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 
293 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  37.41 
 
 
279 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  34.96 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 
292 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 
281 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 
287 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 
279 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  35.79 
 
 
281 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
281 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
318 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 
315 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  37.81 
 
 
291 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 
336 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 
279 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 
285 aa  155  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  34.73 
 
 
287 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  39.53 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  32.53 
 
 
315 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
279 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  32.22 
 
 
283 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
306 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  29.84 
 
 
321 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
278 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  30.88 
 
 
308 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
308 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
308 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
326 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 
330 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
305 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.06 
 
 
293 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
306 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
315 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
320 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  31.4 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.38 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.61 
 
 
332 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
329 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.47 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  29.26 
 
 
272 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 
330 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 
317 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
331 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.67 
 
 
310 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
310 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  28.62 
 
 
329 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>