More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2378 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 330 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  77.64 
 
 		 332 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  62.62 
 
 		 329 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  64.69 
 
 		 313 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  62.77 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  62.77 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  64.17 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  48.17 
 
 		 326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  46.93 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  51.02 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  48.39 
 
 		 314 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  44.1 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  46.86 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  43.61 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  43.95 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  45.23 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  43.53 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  44.22 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  47.22 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  46.9 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  41.03 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  43.88 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  46.21 
 
 		 336 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  45.83 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  40.06 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  42.71 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  40.06 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  44.11 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  42.14 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  40.27 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  38.41 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  38.57 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  41.22 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  41.22 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  40.14 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  38.93 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  37.24 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  34.91 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.7 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  36.04 
 
 		 287 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  35.13 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  36.57 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  36.64 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 		 281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  40.54 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  35.36 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  36.9 
 
 		 279 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  34.24 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  31.31 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  34.52 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  36.77 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.68 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  31.23 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  32.14 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  30.88 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  32.17 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  32.11 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>