288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4084 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  88.3 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  76.07 
 
 		 282 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  71.63 
 
 		 287 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.28 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  41.2 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  36 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  42.31 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  38.08 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  35.17 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  35.66 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  36.01 
 
 		 302 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  36.01 
 
 		 302 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  35.54 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  34.44 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  35.46 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  33.57 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  29.72 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  33.48 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  35.11 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 334 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.6 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.53 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  29.84 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 		 315 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 		 329 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  27.76 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  28.93 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  28.63 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  28.74 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  28.25 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.51 
 
 		 330 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 344 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 		 322 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  31.08 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  26.58 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  27.57 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  26.74 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 326 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  26.9 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  26.86 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.3 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  30.16 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  27.39 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  28.14 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>