285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3353 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 332 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  65.08 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  61.79 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  61.46 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  61.79 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  60.27 
 
 		 299 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  52.3 
 
 		 317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  52.4 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  43.49 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  44.12 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  39.79 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  37.29 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  39.32 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  38.23 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.21 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  39.55 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 		 282 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  37.06 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  39.72 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.87 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  41.81 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  36.24 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  35.06 
 
 		 283 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  35.22 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  33.48 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  30.83 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  29.15 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  34.62 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  32.37 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  32.34 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  29.51 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  28.16 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  33.33 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  33.47 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  29.05 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  31.05 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  31.3 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  31.67 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  31.42 
 
 		 277 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  27.54 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  28.76 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 279 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  29.04 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  28.29 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  32.76 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.69 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  34.19 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  26.92 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.92 
 
 		 293 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  28.05 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.39 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  31.33 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  30.93 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>