274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8804 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  60.27 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  57.14 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  58.45 
 
 		 302 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  57.77 
 
 		 302 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  57.77 
 
 		 302 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  52.96 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  48.14 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  43.84 
 
 		 301 aa  245  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  40.26 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  39.06 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  36.39 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  32.99 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.79 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.33 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  37.54 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  40.07 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  36.4 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  36.3 
 
 		 288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  35.54 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  35.42 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  38.06 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  38.41 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  30.71 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 		 266 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  33.9 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  29.13 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  31.45 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  33.78 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 		 329 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.63 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  27.7 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  29.15 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 334 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  33.05 
 
 		 339 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.58 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  32.86 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  30.74 
 
 		 329 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  28.63 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  25.08 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.18 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.3 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.94 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  29.08 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  27.8 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  29.55 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  28.69 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.73 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>