229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3214 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  51.71 
 
 		 302 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  51.71 
 
 		 302 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  51.71 
 
 		 302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  51.01 
 
 		 304 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  48.98 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  43.71 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  38.01 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  34.56 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  37.68 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  35.93 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.48 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  36.24 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  34.49 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  31.56 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  34.9 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  33.68 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.41 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  31.69 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  30.07 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  34.53 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  36.44 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  29.09 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  30.4 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  27.24 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  27.55 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  27.46 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  25.93 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.93 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  26.83 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  28.08 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  31.38 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.88 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  31.15 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  28.29 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  29.29 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  28.86 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.54 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  27.4 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.54 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  29.14 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.91 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  29.11 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  26.91 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>