276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1080 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  613  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  47.06 
 
 
295 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  45.92 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  45.52 
 
 
292 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  41.02 
 
 
297 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  42.03 
 
 
301 aa  231  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  40.48 
 
 
315 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  42.57 
 
 
302 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 
302 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 
299 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 
282 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 
332 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  40 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  37.2 
 
 
296 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.76 
 
 
287 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  35.56 
 
 
282 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 
317 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  36.14 
 
 
282 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.56 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  37.8 
 
 
306 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  37.15 
 
 
283 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 
299 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  35.89 
 
 
288 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 
294 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  34.04 
 
 
297 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  36.77 
 
 
300 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 
322 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  31.74 
 
 
288 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  30.37 
 
 
327 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
282 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32.92 
 
 
330 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
287 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
279 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 
287 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  33.93 
 
 
312 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  29.53 
 
 
315 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
285 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  29.76 
 
 
279 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
284 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  31.09 
 
 
327 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  30.54 
 
 
238 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
326 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  29.17 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  29.67 
 
 
287 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  29.96 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  29.11 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.93 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
336 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 
327 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
334 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 
327 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
329 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
293 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
311 aa  92.4  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
329 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
279 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  30.99 
 
 
351 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  31.54 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  31.17 
 
 
300 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  27.85 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  33.53 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
279 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
326 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
310 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 
287 aa  89.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 
301 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  31.25 
 
 
348 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
348 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>