253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5423 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  45.1 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  46.18 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  42.07 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  38.23 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  37.63 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  36.08 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  35.79 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  37.24 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  37.05 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  37.54 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.82 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  36.46 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  34.97 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  35.93 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  39.15 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.72 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  34.28 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 322 aa  158  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  32.86 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  29.83 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.24 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  30.14 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  26.83 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  27.37 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 314 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  30.64 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  30.74 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  27.68 
 
 		 327 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 322 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  28.52 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  26.48 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.96 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  28.96 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  28.81 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.73 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.02 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  26.03 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 		 330 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  26.03 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  30.19 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  28.37 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  28.28 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>