281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4233 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  88.3 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  76.79 
 
 		 282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  71.99 
 
 		 287 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.99 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 		 294 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  38.18 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  40.56 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  39.92 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  36.18 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  37.28 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  38.33 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  37.76 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  35.09 
 
 		 315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  37.06 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  37.06 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  37.06 
 
 		 332 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  36.59 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  35.31 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  31.34 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.67 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  29.83 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  29.44 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.85 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  33.51 
 
 		 309 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.87 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  28.62 
 
 		 327 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 329 aa  95.5  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  28.03 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.2 
 
 		 327 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 318 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  28.87 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  29.41 
 
 		 330 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 		 330 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.46 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  27.16 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 		 329 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.61 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.46 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  31.72 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  31.45 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  26.28 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.87 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>