More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4837 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  594  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  36.36 
 
 
282 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  35.12 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  36.36 
 
 
297 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 
295 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.67 
 
 
288 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 
282 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  31.74 
 
 
294 aa  122  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  30.41 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  31.3 
 
 
297 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  33.92 
 
 
288 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  30.18 
 
 
319 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
317 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 
287 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  29.35 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
286 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
332 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
314 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 
293 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  28.63 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  32.04 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
287 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
302 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 
336 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
299 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
287 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
326 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  32.03 
 
 
283 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 
299 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  27.93 
 
 
311 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  35.17 
 
 
339 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  32.4 
 
 
335 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 
279 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 
334 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  31.64 
 
 
327 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
298 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
327 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  30.54 
 
 
306 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  29.52 
 
 
315 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  28.42 
 
 
330 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
308 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.9 
 
 
283 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
316 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  32.73 
 
 
281 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 
281 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 
315 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
320 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  34.2 
 
 
238 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.54 
 
 
321 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
324 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  27.52 
 
 
301 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
324 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  27.15 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.72 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  32.77 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  27.84 
 
 
330 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
315 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  28.37 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.44 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 
310 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.9 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  31.93 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  30.77 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  32.47 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.58 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 
318 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  30.42 
 
 
348 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 
348 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>