292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2454 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  100 
 
 
319 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  75.92 
 
 
306 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  72.16 
 
 
311 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  64.38 
 
 
305 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  69.07 
 
 
302 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  61.88 
 
 
317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  64.45 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  65.4 
 
 
308 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  65.4 
 
 
308 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  65.4 
 
 
308 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  67.82 
 
 
304 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  62.46 
 
 
306 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  60.21 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  60.55 
 
 
310 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  59.52 
 
 
310 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  59.11 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  59.11 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  59.17 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  59.17 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  58.08 
 
 
310 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
311 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 
321 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
324 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
315 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  30.61 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  28.87 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 
329 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  32.87 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.83 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.95 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 
336 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
335 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  29.47 
 
 
326 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
304 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
327 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  27.61 
 
 
321 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
315 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
334 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  31.41 
 
 
300 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.55 
 
 
277 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  30.48 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
330 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
285 aa  119  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
324 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  31.36 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  28.01 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
314 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 
318 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  28.87 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 
322 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  27.11 
 
 
328 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 
301 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
303 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  27.4 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  27.97 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
287 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
313 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
341 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
344 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
287 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  28.01 
 
 
330 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 
312 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
292 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
329 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  26.44 
 
 
327 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  29.43 
 
 
351 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.42 
 
 
312 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 
293 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
326 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  28.52 
 
 
342 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  28.92 
 
 
339 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
282 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  30.29 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
333 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>