278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2866 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
298 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  37.37 
 
 
312 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 
266 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
282 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  32.4 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
318 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 
315 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.4 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  34.71 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 
299 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 
282 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 
301 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
288 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  30.08 
 
 
288 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
332 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.62 
 
 
288 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 
317 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  30.58 
 
 
301 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  29.72 
 
 
302 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
302 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
302 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 
283 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  29.83 
 
 
282 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  27.99 
 
 
283 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  29.63 
 
 
282 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  33.33 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  30.18 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  27.99 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
322 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  28.39 
 
 
304 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  30.2 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
311 aa  92.8  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
316 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
293 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
336 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  26.78 
 
 
326 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 
324 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 
287 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  31.54 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  28.72 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
324 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
293 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  29.45 
 
 
311 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
281 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.31 
 
 
304 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.32 
 
 
332 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  28.87 
 
 
321 aa  89  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
297 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  29.63 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.65 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 
329 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
300 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
326 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 
312 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 
327 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.99 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  29.1 
 
 
342 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  25.5 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  25.75 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  27.74 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  29.11 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.69 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  25.47 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  27.24 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  27.68 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>