264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1891 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  65.08 
 
 		 332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  64.98 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  64.98 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  64.98 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  50.5 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  51.01 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  43.49 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  45.87 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  41.91 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  39.1 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  38.23 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.52 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  34.01 
 
 		 315 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  36.52 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  34.72 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.34 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  33.57 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  38.49 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  30.66 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  33.45 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  32.11 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  28.28 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  29.08 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  28.52 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.87 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 336 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  29.69 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  30.48 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.5 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.86 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  29.57 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.54 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  29.53 
 
 		 348 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 348 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.39 
 
 		 339 aa  89.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  28.1 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  29.27 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.38 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 324 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  30.58 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  29.13 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 293 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.7 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  29.6 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  29.34 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  26.25 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  31.3 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  29.75 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  34.38 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>