More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6124 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 328 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  50.86 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  47.22 
 
 		 339 aa  285  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  48.31 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  45.61 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  43.94 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  46.08 
 
 		 329 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  46.08 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  45.55 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  49.13 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  44.64 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  42.72 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  45.36 
 
 		 351 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  42.71 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  42.71 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  44.11 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  41.84 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  44.21 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  44.03 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  43.25 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  43.04 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  43.04 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  43.73 
 
 		 324 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  43.16 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  42.81 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  40.83 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  44.16 
 
 		 277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  40.97 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  43.84 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  40.97 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  42.03 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  42.26 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  42.26 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  42.05 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  41.44 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 322 aa  175  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  39.86 
 
 		 283 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  40.64 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  38.27 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  40.44 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  40.18 
 
 		 238 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  35.16 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  36.86 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  35.48 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.27 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  32.62 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.76 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  30.41 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 330 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 		 329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  32.34 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  29.73 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  30.27 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.53 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  29.5 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  32.29 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>