220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1508 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  39.79 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  38.01 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  39.1 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  39.06 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  38.73 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  38.73 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  38.73 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  38.01 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  34.49 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  39.18 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  34.46 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.56 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  35.31 
 
 		 282 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.76 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  31.44 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  30.77 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.22 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.79 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  30.1 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.63 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  26.51 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  29 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  24.91 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  28.45 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  25.61 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 330 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  27.2 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  28.4 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.4 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 		 329 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  28.51 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 332 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.89 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  27.66 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  25.34 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  26.25 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  26.61 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  24.24 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  26.94 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>