More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1477 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 322 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  44.14 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  46.13 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  43.4 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  43.06 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  39.39 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  40.35 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  40.66 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  42.75 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  42.75 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  44 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  40.13 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  41.52 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  42.16 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  41.28 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  39.48 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  48.43 
 
 		 238 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  43.33 
 
 		 279 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  41.85 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  41.61 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  37.54 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  34.53 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  40.57 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  38.41 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  33.43 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  36.39 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  37.07 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  37.91 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  42.24 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  36.83 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 278 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  34.62 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  35.64 
 
 		 332 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  36.68 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  36.08 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  34.02 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  33.64 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  37.41 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  37.77 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  36.86 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  38.93 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  33.45 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  39.1 
 
 		 291 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  34.6 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 285 aa  159  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  33.24 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  36.92 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 335 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  34.47 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.45 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.24 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  34.24 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.28 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  32.36 
 
 		 279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 303 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.11 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  34.26 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  31.46 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>