276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5395 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  64.38 
 
 		 319 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  68.01 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  63.91 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  62.75 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  62.75 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  62.75 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  61.59 
 
 		 305 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  61.92 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  59.48 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  63.05 
 
 		 302 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  62.12 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  56.13 
 
 		 311 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  57.48 
 
 		 310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 		 310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  57.48 
 
 		 310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 		 310 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  54.52 
 
 		 310 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  54.18 
 
 		 310 aa  344  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  32.99 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.9 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  33.45 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  29.21 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.62 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 		 334 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  32.76 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  33.1 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  29.83 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.74 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  29.05 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  28.95 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  32.93 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.27 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.53 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.28 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  30.3 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  26.26 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  29.76 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  27.53 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  28.75 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  28.77 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.16 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  28.03 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  30.55 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.42 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>