271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5781 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  99.68 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  90.65 
 
 		 310 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  90.65 
 
 		 310 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  89.68 
 
 		 310 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  89.68 
 
 		 310 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  87.74 
 
 		 311 aa  567  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  88.06 
 
 		 310 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  61.25 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  59.11 
 
 		 319 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  59.31 
 
 		 306 aa  355  5.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 		 305 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  55.84 
 
 		 317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  58.13 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  58.13 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  58.14 
 
 		 305 aa  349  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  57.79 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  54.34 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  56.55 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  55.07 
 
 		 304 aa  325  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  31.51 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  30.28 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.18 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  31.72 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 329 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.02 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  32.07 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.43 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  27.92 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.99 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  30.22 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.56 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  30.77 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 290 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  30.07 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  30.69 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  28.15 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  30.9 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  27.4 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  33.77 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  26.64 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  28.71 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.18 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  28.83 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  29.49 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.07 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 279 aa  96.7  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>