More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3377 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 329 aa  677    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  54.77 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  54.98 
 
 		 327 aa  358  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  55.34 
 
 		 327 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  56.07 
 
 		 335 aa  354  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  51.69 
 
 		 324 aa  345  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  49.07 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  50.16 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  46.67 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  44.48 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  50.86 
 
 		 328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  43.81 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  46.25 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  44.1 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  44.38 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  43.75 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  47.22 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  44.51 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  45.05 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  41.49 
 
 		 321 aa  258  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  44.41 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  44.6 
 
 		 348 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  44.6 
 
 		 348 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  40.32 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  43.2 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  42.18 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  42.12 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  41.55 
 
 		 336 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  39.48 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  43.1 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  39.46 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  38.2 
 
 		 277 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  34.19 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  37.22 
 
 		 281 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 		 281 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 		 329 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  34.91 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  36.64 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  35.84 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  36.77 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  38.89 
 
 		 238 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  33.84 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.89 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 279 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  34.35 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 301 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  31.58 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  37.33 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  28.96 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.56 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  31.47 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  29.76 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  31.99 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  29.1 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.36 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 		 291 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>