More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6348 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  100 
 
 
348 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
348 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  94.54 
 
 
344 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  74.35 
 
 
329 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  75.38 
 
 
313 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  69.34 
 
 
332 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  62.77 
 
 
330 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  47.69 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  46.15 
 
 
339 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  44.11 
 
 
320 aa  269  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 
314 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  48.18 
 
 
342 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  43.73 
 
 
351 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  44.6 
 
 
329 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  43.04 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  44.48 
 
 
322 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 
324 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  41.28 
 
 
321 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  37.13 
 
 
321 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  43.31 
 
 
335 aa  245  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  46.13 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  44.29 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  45.07 
 
 
334 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  42.07 
 
 
324 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  41.58 
 
 
327 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  39.46 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  44.72 
 
 
336 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  40.55 
 
 
327 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  41.67 
 
 
327 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 
324 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  43.84 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  43.49 
 
 
293 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  43.54 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  39.1 
 
 
339 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  42.01 
 
 
290 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  39.4 
 
 
341 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  38.04 
 
 
322 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  40.51 
 
 
315 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  38.89 
 
 
281 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
281 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  34.83 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  40.15 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 
301 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  33.1 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 
279 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  41.97 
 
 
314 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  33.45 
 
 
277 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 
279 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  41.89 
 
 
238 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  40.07 
 
 
301 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  36.46 
 
 
287 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 
329 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
322 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  35.46 
 
 
283 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  37 
 
 
279 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
333 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 
287 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  35.09 
 
 
315 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  36.52 
 
 
304 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
320 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  32.45 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 
287 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  33.68 
 
 
332 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 
329 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 
285 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 
329 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 
324 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.77 
 
 
321 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  32.65 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 
329 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  32.72 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
326 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 
291 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  32.97 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
278 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 
330 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  31.37 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 
326 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  31.74 
 
 
331 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 
310 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.48 
 
 
311 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 
282 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 
310 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 
306 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.38 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
305 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.39 
 
 
279 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  30.03 
 
 
310 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>