263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5798 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  97.42 
 
 
310 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  90.65 
 
 
310 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  90.65 
 
 
310 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  89.68 
 
 
311 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  88.06 
 
 
310 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  87.1 
 
 
310 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  62.28 
 
 
306 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  59.17 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  57.48 
 
 
305 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  56.15 
 
 
317 aa  351  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  57.59 
 
 
306 aa  348  5e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  58.62 
 
 
305 aa  344  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  56.75 
 
 
308 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  56.75 
 
 
308 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  56.75 
 
 
308 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  56.55 
 
 
311 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  56.21 
 
 
302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  53.85 
 
 
304 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  30.51 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 
314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 
327 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.66 
 
 
321 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
320 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.88 
 
 
330 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
322 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.07 
 
 
293 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
332 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.44 
 
 
277 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
326 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
303 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
329 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
324 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  27.53 
 
 
321 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  28.24 
 
 
327 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  30.9 
 
 
322 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.38 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  28.01 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  29.62 
 
 
327 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
329 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  29.29 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  29.45 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
336 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 
329 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
316 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.53 
 
 
327 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  29.51 
 
 
339 aa  109  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
320 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
326 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.41 
 
 
339 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
334 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 
330 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
304 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  28.96 
 
 
339 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 
293 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
326 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  33.77 
 
 
312 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
312 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
333 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  25.52 
 
 
329 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
322 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 
288 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30.94 
 
 
283 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.21 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 
331 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  28.93 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
318 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  26.28 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  28.22 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  28.71 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  28.85 
 
 
351 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  29.01 
 
 
272 aa  92.8  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>