235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3643 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  41.91 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.3 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  41.22 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  38.16 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  40.54 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  38.93 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  39.18 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  35.49 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  38 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  36.46 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.23 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  37.81 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  35.27 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  35.4 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  34.46 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  36.73 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  32.42 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  38.23 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  32.88 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  35.84 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  30.32 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  30.04 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.74 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.09 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  26.26 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  30.24 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  28.38 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  27.3 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  28.47 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  24.69 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  24.83 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  26.94 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  25.75 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  28.02 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  25.91 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  27.97 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  27.83 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  26.77 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  24.66 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  29.33 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  26.07 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  24.68 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  24.58 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.75 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>