257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4741 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 282 aa  591  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  62.5 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  60.95 
 
 		 280 aa  358  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  55.59 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  55.71 
 
 		 279 aa  331  9e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  53.68 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  52.16 
 
 		 287 aa  311  7.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  46.72 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  41.06 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  39.92 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  35.07 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  36.63 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  37.07 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  34.75 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  32.01 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  31.29 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  31.29 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  34.36 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  31.29 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  31.29 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  31.29 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  35.25 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  30.58 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  27.11 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  29.52 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 329 aa  82  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.21 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.63 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  28.5 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  28.12 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  26.46 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  23.81 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  24.03 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  24.79 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  22.98 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  22.98 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  23.5 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  25.63 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  29.38 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  23.18 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  23.95 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  22.18 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  24.01 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  22.94 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  22.32 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  21.64 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.89 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>