194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1518 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  100 
 
 		 279 aa  584  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  57.35 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  55.71 
 
 		 282 aa  331  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  55.91 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  53.17 
 
 		 285 aa  318  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  52.82 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  45.96 
 
 		 286 aa  288  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  41.48 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  35.16 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  38.11 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  35.61 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  34.89 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  33.71 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  34.05 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  31.46 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  30.5 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 		 287 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  30.51 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  29.24 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  29.24 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  29.24 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  29.24 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  30.54 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  26.07 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  26.46 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.78 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  30.67 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  25.7 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  23.35 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  25.35 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  23.89 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  23.2 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.33 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  23.4 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2004  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.867413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.82 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  22.65 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  24.88 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  26.09 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  37.84 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  22.01 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  25.99 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  23.28 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  23.79 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  23.87 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  20.17 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  23.08 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  32.39 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>