228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3821 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  79.51 
 
 		 288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  76.09 
 
 		 288 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  76.45 
 
 		 288 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  59.72 
 
 		 287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  56.07 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  36.63 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  40.96 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  39.03 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  35.19 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  36.92 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  35.79 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  35.4 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  37.88 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  34.18 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 		 282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  31.94 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  32.17 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  31.92 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  32.31 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  32.17 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  32.31 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  35.69 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  31.15 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  31.15 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  31.15 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  26.46 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  26.52 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.81 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  26.25 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  26.56 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  28.04 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  27.07 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  28.34 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  23.46 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  26.85 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  27.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  23.53 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  25.48 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  27.8 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  29.18 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>