260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0336 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  62.59 
 
 
288 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  62.94 
 
 
288 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  62.02 
 
 
288 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  63.36 
 
 
295 aa  363  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  59.72 
 
 
288 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 
285 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
282 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  33.46 
 
 
287 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
285 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  32.49 
 
 
287 aa  148  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 
279 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
280 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  34.2 
 
 
278 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
281 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  33.2 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  32.81 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
286 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  32.03 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  33.7 
 
 
282 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  31.64 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  31.64 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  31.64 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  32.03 
 
 
284 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  31.64 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  32.17 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  32.03 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
302 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 
282 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  31.34 
 
 
280 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 
284 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  35 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 
280 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 
280 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  29.77 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  28.7 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  25.38 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  28.26 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  25.86 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  26.78 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  30.48 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  26.94 
 
 
339 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  23.97 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  24.08 
 
 
321 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 
276 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  25.22 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  25.76 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.64 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  28.31 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  30.28 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  23.77 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 
220 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.81 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  23.08 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  23.62 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
334 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  26.53 
 
 
238 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  25.33 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  30.72 
 
 
332 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  23.6 
 
 
329 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  27.65 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  25.21 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
341 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>