204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03230 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  100 
 
 
287 aa  599  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  77.94 
 
 
285 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  65.12 
 
 
280 aa  371  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  60.7 
 
 
279 aa  364  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  52.82 
 
 
279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  52.16 
 
 
282 aa  311  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  47.95 
 
 
286 aa  295  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 
285 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  39.93 
 
 
278 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 
281 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 
288 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  36.86 
 
 
288 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 
284 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 
284 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  37.93 
 
 
288 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  35.53 
 
 
280 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 
284 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  36.09 
 
 
283 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  34.55 
 
 
288 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  35.91 
 
 
284 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  35.14 
 
 
284 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  35.52 
 
 
284 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  35.52 
 
 
284 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  35.52 
 
 
284 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 
295 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  33.7 
 
 
282 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
302 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  35.14 
 
 
284 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
287 aa  148  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  34.75 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  33.98 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 
284 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  33.09 
 
 
287 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  33.98 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  27.55 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  25 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  23.14 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  24.07 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  25 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 
341 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  24.47 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  24.67 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  22.69 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  23.75 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  24.05 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  24.39 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
282 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  23.6 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  22.43 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.11 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  22.87 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  26.13 
 
 
330 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  27.37 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  26.29 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.03 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  23.35 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  27.33 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 
320 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
331 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  22.78 
 
 
327 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>