233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1292 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 271 aa  524  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  28.52 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 321 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.03 
 
 		 339 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  26.12 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  34.03 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  26.81 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.42 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  29.34 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  24.64 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.86 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.63 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2004  beta-lactamase domain-containing protein  22.98 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.867413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  26.24 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  32 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  22.93 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  28.21 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  28.63 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  28.15 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  27.6 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.11 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  32.18 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  27.65 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  27.39 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  23.22 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  23.95 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  23.95 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  23.95 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  23.14 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  27.71 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.73 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  29.09 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  21.64 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  30.17 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  21.32 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  24.33 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  26.91 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>