201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3002 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 280 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  72.5 
 
 		 279 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  65.12 
 
 		 287 aa  371  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  60.95 
 
 		 282 aa  358  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  60.92 
 
 		 285 aa  355  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  55.91 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  48.78 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  47.5 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  36.47 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  40.93 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  35.52 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  36.68 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  36.29 
 
 		 288 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  34.21 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  34 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  32.39 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  32.39 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  33.2 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  32.39 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  32.39 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  32.39 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  32.39 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  32.39 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  25.22 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.39 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  23.35 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  28.43 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  25.34 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  23.45 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  23.56 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  22.5 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.11 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  23.01 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  28.81 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  26.15 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  25.52 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  24.79 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  23.62 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  21.86 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  22.62 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  23.73 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  23.73 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  22.12 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  23.73 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  23.48 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  23.86 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  22.55 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  22.51 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  23.64 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>