192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1275 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 279 aa  588  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  72.5 
 
 		 280 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  60.7 
 
 		 287 aa  364  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  62.5 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  60.92 
 
 		 285 aa  363  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  57.35 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  47.4 
 
 		 286 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  46.27 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  38.32 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  36.3 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  34.07 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  35.04 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  35.83 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  33.58 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  34.8 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  33.83 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  34.8 
 
 		 288 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 		 284 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  34.25 
 
 		 284 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 		 284 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  34.25 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  33.86 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  31.32 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  32.85 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  25.55 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  22.93 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.97 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  23.85 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.96 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  25.08 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  24.41 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  22.03 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  21.98 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  22.45 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  22.48 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  24.22 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  21.9 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  21.67 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  22.27 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  21.6 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  21.6 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  25.6 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  25.76 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  23.58 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  23.75 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2004  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.867413  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  24.18 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.12 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  33.08 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  21.2 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  19.67 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  19.67 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  26.87 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  22.18 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>