248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1394 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  58.57 
 
 		 284 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  58.42 
 
 		 278 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  54.64 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  44.4 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  38.32 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  37.72 
 
 		 287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  38.27 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  39.63 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  39.63 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  37.59 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  33.58 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  36.53 
 
 		 284 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  36.03 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  36.8 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  32.85 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  32.12 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  32.48 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  32.85 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  32.12 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  32.12 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  32.12 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  32.12 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  32.12 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 281 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 284 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  35.38 
 
 		 288 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  35.38 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  28.64 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  27.52 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  26.39 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  27.9 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  27.2 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.52 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  26.48 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  25 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  28.7 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  24.6 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  24.72 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  24.72 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  32.09 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  25.44 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.8 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  29.2 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.76 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  26.05 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  23.29 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>