200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4240 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 286 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  55.59 
 
 		 282 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  48.8 
 
 		 285 aa  308  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  48.78 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  47.95 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  47.4 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  45.96 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  44.41 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  38.41 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 281 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  38.27 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  38.11 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  39.19 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  37.36 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  36.74 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  38.81 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  34.72 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  35.58 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  35.47 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  35.09 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  29.93 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  29.23 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  29.58 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  28.87 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  28.87 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  24.21 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  24.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  31.06 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  27.63 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  25.33 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  27.11 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  28.26 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  24.4 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  24.18 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  24.73 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  27.27 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  25.41 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  22.32 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  26.81 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  26.54 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  27.37 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 332 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>