188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1554 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  63.36 
 
 
287 aa  363  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  60.62 
 
 
288 aa  342  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  62.14 
 
 
288 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  61.79 
 
 
288 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  56.07 
 
 
288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 
285 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  35.09 
 
 
285 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 
282 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 
286 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
279 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  33.1 
 
 
287 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 
280 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  34.94 
 
 
287 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  34.05 
 
 
279 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  34.15 
 
 
282 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  34.27 
 
 
278 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
284 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  34.2 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
284 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
284 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  33.72 
 
 
283 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
302 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  28.89 
 
 
284 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  28.52 
 
 
284 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  28.52 
 
 
284 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  28.52 
 
 
284 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  28.52 
 
 
284 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  28.52 
 
 
284 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
281 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  28.15 
 
 
284 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  28.15 
 
 
284 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
282 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  28.89 
 
 
284 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  26.62 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.03 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 
326 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
329 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  27.03 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
220 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  30.52 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.72 
 
 
288 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 
321 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  31.67 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  35.17 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  30.14 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  29.94 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  25.69 
 
 
339 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  30.43 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  46.91 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  31.74 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 
314 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29 
 
 
263 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
334 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  27.93 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  27.93 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  27.93 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  27.93 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  27.93 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  27.93 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  28.05 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  28.16 
 
 
348 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  23.19 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
348 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  26.09 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  28.83 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  20.74 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  28.71 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  23.11 
 
 
326 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
326 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>