265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1029 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  57.78 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 
284 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  41.67 
 
 
287 aa  222  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 
285 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  39.56 
 
 
278 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  37.18 
 
 
280 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  33.69 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  35.63 
 
 
284 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  35.63 
 
 
284 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  35.63 
 
 
284 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 
279 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 
284 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 
284 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 
285 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
302 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 
281 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
286 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 
284 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  33.71 
 
 
279 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 
284 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  33.7 
 
 
287 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
288 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
288 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  36.76 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
280 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
280 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
284 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
295 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  34.56 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 
287 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  33.71 
 
 
288 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  33.71 
 
 
288 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
282 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  30.84 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
315 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  28.03 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.69 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  29.57 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  28.25 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  28.22 
 
 
283 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
299 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  25.9 
 
 
327 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  26.12 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  34.68 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.27 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  33.52 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  34.71 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  29.72 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.32 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  25.87 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  26.59 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  28.33 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  29.05 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  29.09 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  29.48 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  29.09 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  28.81 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  44.14 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  29.69 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>