255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3682 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  44.12 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2004  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.867413  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 312 aa  92.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  27.07 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  27.2 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.78 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 		 329 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  25.94 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  26.36 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  25.94 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  27.51 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  26.78 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.88 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  25.52 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  25.91 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  26.36 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  25.42 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  25.68 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 326 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  25.84 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  25.94 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  25.32 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  25.53 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  28.51 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  26.09 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  27.45 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 286 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 301 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  25.32 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  27.48 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.01 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  27.05 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  27.12 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  23.81 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 330 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  26.44 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  24.45 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  26.37 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  27.18 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  23.62 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  24.57 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  25.34 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  27.51 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  27.5 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.21 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>