More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0664 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  84.87 
 
 		 279 aa  424  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  84.45 
 
 		 279 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  70.46 
 
 		 279 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  73.42 
 
 		 281 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  73.42 
 
 		 281 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  72.57 
 
 		 281 aa  354  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  67.92 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  67.09 
 
 		 287 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  57.2 
 
 		 287 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  57.21 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  51.68 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  53.54 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  50.9 
 
 		 293 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  51.35 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  50.9 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  48.43 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  47.79 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  53.12 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  42.11 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  42.41 
 
 		 342 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  44.14 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  41.26 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  42.52 
 
 		 315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  40.09 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  43.69 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  41.82 
 
 		 318 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  38.08 
 
 		 327 aa  161  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 		 327 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  38.43 
 
 		 332 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  42.41 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  40.18 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 329 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  40.09 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  40.54 
 
 		 330 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 336 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  38.05 
 
 		 321 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  37.22 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 		 314 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  38.74 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  39.19 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 344 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  41.89 
 
 		 348 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 348 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 326 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 335 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  38.96 
 
 		 329 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 322 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  38.96 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 		 336 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  38.77 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  35.5 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  33.61 
 
 		 329 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 		 329 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 		 329 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 279 aa  141  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  38.43 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  35.78 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  35 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  36.84 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 		 329 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  32.33 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  35.24 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 291 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  37.67 
 
 		 315 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  35.12 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 333 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 303 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 		 316 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 304 aa  118  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  38.43 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.22 
 
 		 293 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 331 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 330 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1577  hypothetical protein  31.43 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 		 332 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>